V současné době se společnost Dekonta, a.s. podílí na řešení následujících výzkumných projektů:
- Ekologicky šetrné nanotechnologie a biotechnologie pro čištění vod a půd
- Vývoj kombinované technologie nano-bio k sanaci znečištění chrómem
- Čištění odpadních vod v integrovaném biotechnologickém systému
- Vývoj technologií pro čištění srážkových smyvů z komunikací a jiných zpevněných ploch
- Inovace a využití cirkulačních vrtů s vloženým reaktorem v sanační geologii
- Technologie hydrotermální konverze organických látek na plynné produkty
- Výzkum, vývoj a technologické uplatnění kombinovaného biologického dekontaminačního systému a vliv biosurfaktantu na odstraňování směsí hydrofobních a hydrofilních par polutantů
- Vývoj a technologické uplatnění kombinovaných dekontaminačních jednotek pro odstraňování emisí VOC včetně pachových látek
- Testování sanační technologie MIP-IN v různých geologických prostředích a za různých podmínek
- In situ termická desorpce s využitím mikrovln
- Dekontaminace brownfieldů komplexně kontaminovaných organickými látkami i těžkými kovy
- Systém biotechnologického čistění odpadních vod v zemědělství a jejich recyklace
- Elektrochemické odstraňování toxických kovů ze znečištěných vod
- Vývoj a testování metody tepelně podporované in-situ anaerobní bioremediace chlorovaných kontaminantů v horninovém prostředí
- Termofilní biofiltrace - komplexní technologie pro využití v běžné praxi za provozně a environmentálně udržitelných podmínek
- Udržitelná technologie pro odstranění dusičnanů ze zemědělských smyvů